ダンジョンBOSS型 (階数は出現に必要なダンジョンの合計階数) ユクシーLV42 熱水の洞窟最上部 8+7F エムリットLV42 流砂の洞窟最深部 10+10F アグノムLV42 水晶の湖 13F ディアルガLV48 時限の塔 13+10F パルキアLV48 空の裂け目最深部 15+9F  レジアイスLV46 番人の洞窟 3F レジロックLV46 番人の洞窟 3+3F レジスチルLV46 番人の洞窟 3+3+4F レジギガスLV46 番人の洞窟最深部 3+3+4+5F フリーザーLV43 雪崩山 19F ミュウLV46 ミステリージャングル 29F カイオーガLV49 底なし海 49F グラードンLV49 陽炎の砂漠 9F レックウザLV49 天空の階段 49F ヒードランLV49 巨大火山 19F ギラティナLV48 世界の大穴 29F 挑戦状型 ミュウツーLV75,80 天空の階段25〜49F  25〜29F:LV75 30〜49F:LV80 (依頼出現条件:シークレットランク獲得、天空の階段にいける) スイクンLV65 魔の海域10〜19F (依頼出現条件:シークレットランク獲得、南東諸島にいける) ライコウLV65,70 南東諸島12〜24F  12〜19F:LV65 20〜24F:LV70 (依頼出現条件:シークレットランク獲得、烈火の洞窟にいける) エンテイLV65,70 烈火の洞窟15〜29F  15〜19F:LV65 20〜29F:LV70 (依頼出現条件:シークレットランク獲得、魔の海域にいける) ジラーチLV32 星の洞窟最奥部 19F+1F (依頼出現条件:シークレットランク獲得、「ビッパの願い事」をクリアしている) 野生型 サンダーLV49 エレキ平原7F リゾート出現:○ パーツor石版:○ ファイヤーLV44 巨大火山10F リゾート出現:○ パーツor石版:× ルギアLV45 閉ざされた海19F リゾート出現:× パーツor石版:○ ホウオウLV43 風の霊峰19F リゾート出現:× パーツor石版:○ セレビィLV44 神秘の森10F リゾート出現:○ パーツor石版:○ デオキシスLV45 輝きの丘17F リゾート出現:× パーツor石版:○ ラティアスLV44 リゾート出現:○ パーツor石版:○ 空の裂け目10F ラティアスLV43  幸せ岬19F ラティオスLV44 リゾート出現:○ パーツor石版:○ 暗夜の森24F 空の裂け目最深部5F ダークライLV53 リゾート出現:○ パーツor石版:○ 神秘の森13F 奇跡の海3F 修行の山17F 空の裂け目14F クレバスの洞窟最深部 2F 時限の塔出現デオキシス(仲間にならない) 5F デオキシスSF LV45 6F デオキシスDF LV45 7F デオキシスAF LV45 イベント型 シェイミLV55 空の頂頂上 (3+3+3+3+4+4+)4+4+5+5F  2回目の空の頂頂上到着時にイベント発生、仲間になる。 フィオネLV40 奇跡の海奥地 18+4F  2度目の奇跡の海奥地到着時にイベント発生、仲間になる。 クレセリアLV47 サメハダ岩  ダークライ撃破後に海岸にて話しかける。 マナフィLV40 サメハダ岩  ダークライ撃破後3回依頼をこなした後、自動的にイベント突入。